Na primeira Copa América realizada no Paraguai, o Brasil novamente não deu chances aos rivais e conquistou o bicampeonato da Copa América e o sexto título da competição em sua história. Em seis partidas, o time treinado por Vanderlei Luxemburgo venceu todas, marcando 17 gols e sofrendo apenas dois. Na decisão, bateu o Uruguai pelo imponente placar de 3 x 0, deixando clara sua superioridade. A Seleção Uruguaia, com uma equipe renovada, chegou à final vencendo apenas um jogo, um recorde na história do torneio.
Os atacantes Ronaldo e Rivaldo, com 5 gols cada, foram os artilheiros da Copa América. Outro brasileiro, Amoroso, marcou 4 gols, ficando logo abaixo dos dois. Dida, Cafu, Roberto Carlos, Ronaldinho Gaúcho, Émerson e Zé Roberto foram também peças fundamentais na conquista. O México, mais uma vez, terminou na terceira colocação. Já o anfitrião, Paraguai e a Colômbia figuraram entre as maiores decepções ao serem eliminados precocemente. A Copa América de 1999, marcou ainda a estréia de um país de fora do continente americano, o Japão, também eliminado na primeira fase.
Os dois melhores jogadores de todos os tempos não conquistaram a Copa América. O brasileiro Pelé disputou apenas uma edição, em 1959, quando foi artilheiro (com 8 gols) e vice-campeão. Já o argentino Maradona disputou três vezes a Copa América, sem conseguir o título (1979, 1987 e 1989).