En la primera Copa América realizada en Paraguay, Brasil nuevamente no le dio oportunidad a sus rivales y conquistó el bicampeonato de la Copa América y el sexto título de la competición en su historia. En seis partidos, el equipo dirigido por Vanderley Luxemburgo venció todos ellos, marcando 17 goles y sufriendo solamente dos contra. En la decisión, derribó a Uruguay ante un imponente 3 a 0, dejando clara su superioridad. La selección uruguaya, con un equipo renovado, llegó a la final venciendo apenas un partido, un record en la historia del torneo.
Los atacantes Ronaldo y Rivaldo, con 5 goles cada uno, fueron los artilleros de la Copa América. Otro brasileño, Amoroso, marcó 4 goles, fue tercero en la lista. Dida, Cafu, Roberto Carlos, Ronaldinho Gaúcho, Émerson y Zé Roberto también fueron piezas fundamentales en la conquista. México, una vez más, terminó en la tercera colocación. Por su parte, el anfitrión, Paraguay y Colombia figuraron entre las mayores decepciones siendo rápidamente eliminados. La Copa América de 1999, marcó el estreno de Japón, un país fuera del continente americano, y que también resultó eliminado en la primera fase.
El estadio Nacional, localizado en la ciudad de Santiago, en Chile, es el estadio que más sedió partidos de Copa América: 68 juegos. El segundo lugar es del estadio Centenario, de Montevideo, Uruguay, con 65 partidos.